Bệnh tay chân miệng có những biểu hiện gần giống với nhiều bệnh khác như zona, thủy đậu, mụn nước... nên khiến cho các bậc cha mẹ nhầm lẫn. Điều này dẫn tới việc chậm trễ hoặc sai lầm trong chữa trị khiến bệnh tiến triển nhanh hơn và khó kiểm soát khi bị nặng.